天主教曾在唐朝、元朝两度伴随西北少数民族的入侵而传入中国，但都没有流传下来。明清之际，天主教由耶苏会再次传入，由于该会的传教士采取了尊重中国文化与传统习俗的态度，成功地在中国民间扎下根来。明天启五年（西元1625年），耶稣会传教士艾儒略（今译若瑟）在相国叶向高长孙的协助下，在福州城内宫巷建起福州历史上第一座天主堂——三山堂。艾儒略学时渊博，又能尊重中国习俗，有“西来孔子”之称，很受官民欢迎，在中国的传教成绩斐然，据清初统计，福建福安地区的教徒约占全国的一半。
康熙四十六年（1707年），罗马教廷将福建传教区单独授与多明我会。多明我会与耶苏会的主张相反，要求教徒放弃自己的传统如对祭祀祖先等，改按欧洲人的方式生活。在两会的争论中，罗马教廷站在了多明我会一边，并最终使耶稣会解散。由于多明我会不尊重中国传统文化，反对中国传统礼仪，使得福州天主教徒中的知识分子人数日渐减少。多明我会与罗马教廷的倒行逆施，危及了清朝的统治基础，康熙五十九年（1720年），清廷下令禁止天主教在中国的传播，没收教堂，驱逐外国传教士，勒令奉教者改过自新。福州三山堂被充公后改为关帝庙。
虽然清庭禁止天主教传播，但终究难免日久懈怠，加上因清庭吏治腐败，天主教仍能在地下生存和传播，并逐渐向以往不受官方注意的省城福州发展，澳尾巷天主堂就建于此一时期。
澳尾巷天主堂建于清道光二十八年(1848年)，地址在茶亭澳尾巷。初为福建代牧区驻福州办事处。光绪九年(1883年)至宣统三年(1911年)，为福建北境代牧区主教座堂。
澳尾巷天主堂外观宏伟挺拔，且矗立着两座大钟楼，每日早6时、午12时、晚6时各鸣钟一次，钟声嘹亮，十里之外亦能闻之。每逢庆典节日钟声嘹亮(1958年炼钢时钟被拿走)，正门留存“奉旨”等石刻和建堂纪事石碑；殿顶还有4幅御笔的颂联镶在4个角落，堂内2个方形石柱和8个圆形石柱都镶有名人颂主的联幅，是福州最早的教堂之一。
堂内为中国宫殿式大木架结构，外观为西洋式砖石结构的中外风格结合的建筑，占地面积364平方米，堂内能容纳1000名左右信徒过宗教生活。教会中重大庆典多在此堂举行，其中有神父江清华晋铎金庆纪念、多明我会在闽传教300年纪念、主教赵炳华祝圣大典，罗马教廷第二任驻华代表总主教蔡宁来闽视察举行大礼弥撒等，场面十分庄严。
